

Malgrat que la Fundació Banc dels Aliments és una entitat sense afany de lucre, gestionada per voluntaris, el funcionament ha d'organitzar-se sobre la base d'uns paràmetres totalment paral·lels als que són necessaris per al funcionament d'una empresa.
La seva infraestructura està constituïda pel magatzem principal, situat al carrer de Motors, núm. 122, de Barcelona, i un petit local secundari, cedit per l'Ajuntament de Barcelona dins el recinte de Mercabarna, on es recuperen i distribueixen excedents de fruites i hortalisses.
L'horari d'activitats del magatzem principal és de dilluns a divendres, de 8.30 a 13.00 hores, mentre que l’horari d’oficines és de 8.00 a 14.00 hores. La limitació de l'espai disponible per a la càrrega i descàrrega de mercaderies obliga a fer un repartiment de les tasques segons els dies de la setmana. D'aquesta manera, els dilluns, dimarts i dijous es destinen a la distribució d'aliments a les entitats receptores, mentre que els dimecres i divendres són els dies reservats per a la recepció i emmagatzematge de les donacions que efectuen les empreses.
Pel que fa al local de Mercabarna, l'activitat que s'hi du a terme, recuperació d'excedents de fruita i verdura fresques, no permet l’emmagatzematge, motiu pel qual la distribució ha de fer-se de forma immediata. L’horari de funcionament és diari, de dilluns a divendres, de 14.00 a 18.00 hores. S'estableix una planificació de les entregues a les entitats receptores, que hi acudeixen amb els seus propis mitjans de transport a retirar els aliments. A partir de maig del 2009, s’ha posat en marxa el servei de recollida d’excedents de producte fresc parada per parada els dimarts i els divendres de 14.00 a 18.00 hores i en qualsevol dia que truquin al magatzem del Banc dels Aliments.
La complexitat que comporta el desenvolupament de totes les funcions, tant les bàsiques com les de suport, que es realitzen en els dos centres d'activitat, fa necessària l'existència d'una coordinació permanent, que difícilment pot ser assumida per voluntaris. Per aquest motiu, el Banc disposa d’una direcció professional, únic element que pot assegurar un funcionament eficaç.